Le Registre comprend 3 équipes à Lille, Amiens et Rouen.
Il est dirigé par les Professeurs Antoine Cortot et Jean-Louis Salomez (Lille).

L'équipe est composée de gastro-entérologues dont le responsable est le Professeur Antoine Cortot, le Docteur Raymond Marti, praticien libéral et le Professeur Jean Frédéric Colombel. La seconde partie de l'équipe est constituée par les épidémiologistes sous l’autorité du Professeur Jean Louis Salomez. Le Docteur Corinne Gower-Rousseau, gastroentérologue et épidémiologiste,  les Docteurs Bruno Grandbastien et Stéphane Debeugny, épidémiologistes, assurent la coordination de ces équipes.

Pour le Nord Pas de Calais, nous employons actuellement 3 médecins enquêteurs mi-temps. Ils collectent les dossiers d'incidence et assurent les études de suivi. Un 4ème médecin enquêteur a travaillé sur un protocole débuté en 1994 sur la prise en charge diagnostique et thérapeutique des MICI, étude parallèle soutenue par le Ministère de la Santé dans le cadre du Programme Hospitalier de Recherche Clinique 1993. Une infirmière-enquêtrice est employée depuis 1996, dans le cadre de l’étude génétique européenne multicentrique Biomed 2.

L'équipe gastroentérologique est composée du Professeur Jean Louis Dupas et du Docteur Thierry Yzet du CH et U d'Amiens. Un médecin enquêteur travaille à mi-temps à la fois sur l'étude d'incidence et sur les études parallèles.

L'équipe est également mixte (gastro-entérologues et épidémiologistes). La partie gastro-entérologique est assurée par le Professeur Eric Lerebours du CH et U de Rouen. La partie épidémiologique comprend le Docteur Véronique Merle. Deux médecins enquêteurs, chacun à quart-temps, se sont divisés le département pour l'étude d'incidence et pour les études parallèles.